จากตระกูลภาษาออสโตรนีเซียนที่ชาวมอแกนใช้และจากการสืบสาวเรื่องราวเกี่ยวกับชนเผ่าที่เดินทาง
ทางทะเลในแถบเอเชียตะวันออกเฉียงใต้คาดกันว่าชาวมอแกนคงจะสืบเชื้อสายมาจากกลุ่มโปรโตมาเลย์
(Proto Malay)ซึ่งเป็นคนพวกแรกๆ ที่อพยพมาอยู่ในบริเวณแหลมมลายูต่อมาคนกลุ่มนี้หันมาใช้ชีวิตทางทะเล
เดินทางร่อนเร่ทำมาหากินตามหมู่เกาะและชายฝั่ง ครอบคลุมอาณาบริเวณตั้งแต่หมู่เกาะมะริดในเมียนมาร์
หรือพม่า ต่อเนื่องไปทางใต้และตะวันออกจนถึงหมู่เกาะในทะเลซูลูประเทศฟิลิปปินส์รวมทั้งเกาะและชายฝั่ง
ในมาเลเซียและอินโดนีเซีย แต่ปัจจุบันการเดินทางจำกัดลงมาก และคนกลุ่มเหล่านี้ก็แยกย้ายกระจัดกระจาย
พัฒนาการของสังคมวัฒนธรรมและภาษาก็ต่างกันออกไปจนแยกเป็นกลุ่มย่อยหลายกลุ่ม
มีหลายคนสงสัยว่าชาว “มอแกน” เป็นกลุ่มเดียวกันกับชาว “มานิ” หรือที่รู้จักกันในชื่อของซาไกหรือไม่
ชาวมอแกนกับชาวมานิมีลักษณะทางกายภาพต่างกัน ขณะที่กลุ่มมานิเป็นเนกริโต (negrito) กลุ่มมอแกน
เป็นโปรโตมาเลย์ ภาษาที่ใช้ก็ต่างกัน ชาวมานิพูดภาษาตระกูลออสโตรเอเชียติก ซึ่งเป็นภาษากลุ่มมอญ เขมร
และชาวมานิเองก็แยกได้เป็นกลุ่มย่อย ๆ ที่มีภาษาถิ่นต่างกันออกไปอีก ส่วนชาวมอแกนพูดภาษาตระกูล
ออสโตรนีเชียน และก็มีภาษาถิ่นย่อยๆ เช่นเดียวกัน ยังมีหลายคนที่เข้าใจผิดว่าชาวมอแกนสืบเชื้อสายมาจาก
ชนพื้นเมืองของหมู่เกาะนิโคบาร์-อันดามันในประเทศอินเดีย ซึ่งจริง ๆ แล้ว ไม่ใช่เช่นนั้น ชนพื้นเมืองที่นั่น
มีหลายกลุ่มและส่วนใหญ่เป็นเนกริโตเช่นเดียวกับชาวมานิ
[ที่มา:ทักษะวัฒนธรรมชาวเล]